Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SLC50A1-204ENST00000368405 1003 ntTSL 214.23□□□□□ -0.131e-17■■■■■ 72.6
PABPC4Q13310 SLC50A1-208ENST00000484027 596 ntTSL 314.23□□□□□ -0.131e-17■■■■■ 72.6
PABPC4Q13310 SLC50A1-207ENST00000479579 475 ntTSL 39.68□□□□□ -0.861e-17■■■■■ 72.6
PABPC4Q13310 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.885e-7■■■■■ 72.5
PABPC4Q13310 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 72.4
PABPC4Q13310 PPM1N-206ENST00000415077 1953 ntTSL 1 (best)21.22■□□□□ 0.992e-8■■■■■ 72.2
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PABPC4Q13310 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 72.2
PABPC4Q13310 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 72.2
PABPC4Q13310 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.116e-8■■■■■ 72.2
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PABPC4Q13310 AC012309.1-201ENST00000588873 389 ntAPPRIS P1 TSL 514.08□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 72.2
PABPC4Q13310 AC012309.1-202ENST00000590245 575 ntTSL 512.61□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 72.2
PABPC4Q13310 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 72.2
PABPC4Q13310 PPWD1-207ENST00000510930 2019 ntTSL 211.83□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 72.2
PABPC4Q13310 ZNF585A-203ENST00000392157 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 72.2
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PABPC4Q13310 PPWD1-209ENST00000511908 1981 ntTSL 29.33□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 72.2
PABPC4Q13310 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 72.2
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PABPC4Q13310 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 72.2
PABPC4Q13310 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 72.2
PABPC4Q13310 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.58□□□□□ -1.526e-8■■■■■ 72.2
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PABPC4Q13310 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-10■■■■■ 71.8
PABPC4Q13310 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-10■■■■■ 71.8
PABPC4Q13310 PRG2-204ENST00000533605 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.252e-10■■■■■ 71.8
PABPC4Q13310 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.9■□□□□ 0.33e-20■■■■■ 71.8
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PABPC4Q13310 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 71.6
PABPC4Q13310 SLC44A2-202ENST00000407327 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-10■■■■■ 71.6
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PABPC4Q13310 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 71.3
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PABPC4Q13310 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.498e-32■■■■■ 70.2
PABPC4Q13310 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.461e-9■■■■■ 70.1
PABPC4Q13310 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.931e-9■■■■■ 70.1
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PABPC4Q13310 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 68.9
PABPC4Q13310 RFXANK-208ENST00000540977 389 ntTSL 213.28□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 68.9
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PABPC4Q13310 PPP1CA-204ENST00000526510 1677 ntTSL 1 (best)22.36■■□□□ 1.177e-45■■■■■ 68.6
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PABPC4Q13310 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 67.8
PABPC4Q13310 CCNC-216ENST00000523961 1152 ntTSL 514.9□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 67.8
PABPC4Q13310 CCNC-203ENST00000369220 2118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 67.8
PABPC4Q13310 CCNC-215ENST00000523799 1035 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 67.8
PABPC4Q13310 CCNC-201ENST00000326298 2212 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.847e-7■■■■■ 67.8
PABPC4Q13310 RPL22L1-201ENST00000295830 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 67.4
PABPC4Q13310 RPL22L1-206ENST00000494771 587 ntTSL 310.53□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 67.4
PABPC4Q13310 RPL22L1-202ENST00000463836 506 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 67.4
PABPC4Q13310 RPL22L1-204ENST00000475836 581 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 67.4
PABPC4Q13310 RPL22L1-205ENST00000478578 900 ntTSL 27.26□□□□□ -1.251e-8■■■■■ 67.4
PABPC4Q13310 RPL22L1-203ENST00000466674 545 ntTSL 36.06□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 67.4
PABPC4Q13310 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.551e-14■■■■■ 67.3
PABPC4Q13310 AKR7A2-202ENST00000330072 1171 ntTSL 222.21■■□□□ 1.151e-14■■■■■ 67.3
PABPC4Q13310 UBXN2A-203ENST00000446425 2195 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.478e-9■■■■■ 67.1
PABPC4Q13310 NT5C-213ENST00000583655 1315 ntTSL 225.86■■□□□ 1.733e-7■■■■■ 66.8
PABPC4Q13310 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.663e-7■■■■■ 66.8
PABPC4Q13310 NT5C-209ENST00000580758 958 ntTSL 222.69■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 66.8
PABPC4Q13310 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.153e-7■■■■■ 66.8
PABPC4Q13310 NT5C-205ENST00000578407 720 ntTSL 322.1■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 66.8
PABPC4Q13310 NT5C-212ENST00000582744 921 ntTSL 219.4■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 66.8
PABPC4Q13310 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.683e-13■■■■■ 66.6
PABPC4Q13310 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 66.5
PABPC4Q13310 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 66.5
PABPC4Q13310 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 66.5
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