Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCGB2A2Q13296 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCGB2A2Q13296 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCGB2A2Q13296 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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SCGB2A2Q13296 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCGB2A2Q13296 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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SCGB2A2Q13296 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCGB2A2Q13296 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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