Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BNIP3Q12983 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BNIP3Q12983 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BNIP3Q12983 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BNIP3Q12983 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BNIP3Q12983 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BNIP3Q12983 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNIP3Q12983 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BNIP3Q12983 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BNIP3Q12983 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BNIP3Q12983 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BNIP3Q12983 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BNIP3Q12983 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BNIP3Q12983 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BNIP3Q12983 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
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