Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTP4A2Q12974 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTP4A2Q12974 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTP4A2Q12974 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
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