Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN13Q12923 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN13Q12923 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN13Q12923 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN13Q12923 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN13Q12923 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN13Q12923 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms