Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIF5AQ12840 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KIF5AQ12840 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF5AQ12840 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF5AQ12840 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF5AQ12840 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIF5AQ12840 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF5AQ12840 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF5AQ12840 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF5AQ12840 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF5AQ12840 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF5AQ12840 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF5AQ12840 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF5AQ12840 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KIF5AQ12840 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KIF5AQ12840 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF5AQ12840 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF5AQ12840 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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