Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 PBP1YGR178C 2169 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 PCL1YNL289W 840 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 ARR1YPR199C 885 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 POP4YBR257W 840 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 YKR015CYKR015C 1707 nt9.49□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 YCR049CYCR049C 447 nt9.49□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 RRP15YPR143W 753 nt9.49□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 BIO5YNR056C 1686 nt9.48□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 MAD2YJL030W 591 nt9.48□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 IDH1YNL037C 1083 nt9.48□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 BIO4YNR057C 714 nt9.48□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 YAP7YOL028C 738 nt9.48□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 OMA1YKR087C 1038 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 VPS20YMR077C 666 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 MRPS8YMR158W 468 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 TGS1YPL157W 948 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 ISR1YPR106W 1332 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 XDJ1YLR090W 1380 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-BRQ12217 CBS1YDL069C 690 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 NPL3YDR432W 1245 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 ENT5YDR153C 1236 nt9.45□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 RPF2YKR081C 1035 nt9.45□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 DSK2YMR276W 1122 nt9.45□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 POS5YPL188W 1245 nt9.45□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.45□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 LSB5YCL034W 1065 nt9.44□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 PRP4YPR178W 1398 nt9.44□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 DPS1YLL018C 1674 nt9.44□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 SNF1YDR477W 1902 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 ELO1YJL196C 933 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 AAC1YMR056C 930 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 IZH4YOL101C 939 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 TSR3YOR006C 942 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 SHE9YDR393W 1371 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 YEL076CYEL076C 651 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 YLR464WYLR464W 651 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 PEX25YPL112C 1185 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 ATG29YPL166W 642 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 SPR1YOR190W 1338 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 CLB5YPR120C 1308 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 ERV41YML067C 1059 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 SIM1YIL123W 1431 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 CHA1YCL064C 1083 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 CSL4YNL232W 879 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 DCP1YOL149W 696 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 BTS1YPL069C 1008 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-BRQ12217 RMD5YDR255C 1266 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 EDC1YGL222C 528 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 GTR1YML121W 933 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 MRPL24YMR193W 777 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 YPL068CYPL068C 882 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 SLM4YBR077C 489 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 PCD1YLR151C 1023 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 SPG5YMR191W 1122 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 SSP2YOR242C 1116 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 NCE102YPR149W 522 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 BTT1YDR252W 450 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 YKL097CYKL097C 411 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 ATG22YCL038C 1587 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 NPL6YMR091C 1308 nt9.34□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 CYT2YKL087C 675 nt9.34□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 CCA1YER168C 1641 nt9.34□□□□□ -0.91
TY1A-BRQ12217 BRL1YHR036W 1416 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 UBC5YDR059C 447 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 GFD1YMR255W 567 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 IDP3YNL009W 1263 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 COS6YGR295C 1146 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 PCM1YEL058W 1674 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 OAC1YKL120W 975 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 BMT6YLR063W 1098 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 RPC53YDL150W 1269 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 YDR029WYDR029W 315 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 CMP2YML057W 1815 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 MED2YDL005C 1296 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 SEC28YIL076W 891 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 MOB1YIL106W 945 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 AIM2YAL049C 741 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 PGC1YPL206C 966 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 VAC17YCL063W 1272 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 SCEIQ0160 708 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 SAW1YAL027W 786 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 SRL2YLR082C 1179 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-BRQ12217 DED1YOR204W 1815 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1A-BRQ12217 YDR541CYDR541C 1035 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1A-BRQ12217 POP5YAL033W 522 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1A-BRQ12217 SDS22YKL193C 1017 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1A-BRQ12217 END3YNL084C 1050 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1A-BRQ12217 SLZ1YNL196C 897 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1A-BRQ12217 YOL079WYOL079W 399 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1A-BRQ12217 ARL3YPL051W 597 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1A-BRQ12217 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.6 ms