Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC173Q0VFZ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC173Q0VFZ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC173Q0VFZ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC173Q0VFZ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC173Q0VFZ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC173Q0VFZ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC173Q0VFZ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC173Q0VFZ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC173Q0VFZ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC173Q0VFZ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC173Q0VFZ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC173Q0VFZ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC173Q0VFZ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC173Q0VFZ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC173Q0VFZ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC173Q0VFZ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC173Q0VFZ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC173Q0VFZ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC173Q0VFZ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC173Q0VFZ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC173Q0VFZ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC173Q0VFZ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC173Q0VFZ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC173Q0VFZ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC173Q0VFZ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC173Q0VFZ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC173Q0VFZ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC173Q0VFZ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms