Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CGNL1Q0VF96 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CGNL1Q0VF96 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CGNL1Q0VF96 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CGNL1Q0VF96 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CGNL1Q0VF96 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CGNL1Q0VF96 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CGNL1Q0VF96 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CGNL1Q0VF96 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CGNL1Q0VF96 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CGNL1Q0VF96 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CGNL1Q0VF96 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CGNL1Q0VF96 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CGNL1Q0VF96 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CGNL1Q0VF96 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms