Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 ERG6YML008C 1152 nt9.63□□□□□ -0.87
SGO1Q08490 CCT5YJR064W 1689 nt9.63□□□□□ -0.87
SGO1Q08490 YJL055WYJL055W 738 nt9.61□□□□□ -0.87
SGO1Q08490 PLB1YMR008C 1995 nt9.61□□□□□ -0.87
SGO1Q08490 TIP1YBR067C 633 nt9.59□□□□□ -0.87
SGO1Q08490 UGA4YDL210W 1716 nt9.59□□□□□ -0.87
SGO1Q08490 MET2YNL277W 1461 nt9.58□□□□□ -0.88
SGO1Q08490 RTN2YDL204W 1182 nt9.56□□□□□ -0.88
SGO1Q08490 SOD2YHR008C 702 nt9.56□□□□□ -0.88
SGO1Q08490 INA1YLR413W 2028 nt9.55□□□□□ -0.88
SGO1Q08490 YIA6YIL006W 1122 nt9.54□□□□□ -0.88
SGO1Q08490 YGL114WYGL114W 2178 nt9.53□□□□□ -0.88
SGO1Q08490 THI72YOR192C 1800 nt9.52□□□□□ -0.89
SGO1Q08490 TAF13YML098W 504 nt9.52□□□□□ -0.89
SGO1Q08490 UTR1YJR049C 1593 nt9.51□□□□□ -0.89
SGO1Q08490 MUP1YGR055W 1725 nt9.5□□□□□ -0.89
SGO1Q08490 PAR32YDL173W 888 nt9.49□□□□□ -0.89
SGO1Q08490 MAE1YKL029C 2010 nt9.48□□□□□ -0.89
SGO1Q08490 YMR262WYMR262W 942 nt9.47□□□□□ -0.89
SGO1Q08490 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.46□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.46□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.46□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.46□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.46□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 SED1YDR077W 1017 nt9.45□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 POP2YNR052C 1302 nt9.44□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 QDR2YIL121W 1629 nt9.43□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 GAL3YDR009W 1563 nt9.43□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 CSM1YCR086W 573 nt9.43□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 TUB4YLR212C 1422 nt9.42□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.42□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 YGR139WYGR139W 339 nt9.41□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 SNZ1YMR096W 894 nt9.41□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 YJL118WYJL118W 660 nt9.4□□□□□ -0.9
SGO1Q08490 SFP1YLR403W 2052 nt9.4□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 HIF1YLL022C 1158 nt9.39□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 GSF2YML048W 1212 nt9.38□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 YPL251WYPL251W 303 nt9.37□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 YCP4YCR004C 744 nt9.36□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 LSB5YCL034W 1065 nt9.36□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 HOL1YNR055C 1761 nt9.36□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 APS2YJR058C 444 nt9.35□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 MHF1YOL086W-A 273 nt9.35□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 SSN3YPL042C 1668 nt9.35□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 POT1YIL160C 1254 nt9.34□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 LIP1YMR298W 453 nt9.34□□□□□ -0.91
SGO1Q08490 GID7YCL039W 2238 nt9.33□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 SAM3YPL274W 1764 nt9.32□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 RIB7YBR153W 735 nt9.32□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 MEP3YPR138C 1470 nt9.32□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 NPP1YCR026C 2229 nt9.32□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 SAM35YHR083W 990 nt9.31□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 YPR126CYPR126C 309 nt9.31□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 RPT5YOR117W 1305 nt9.31□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 ACO2YJL200C 2370 nt9.3□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 SAM50YNL026W 1455 nt9.3□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 BUD20YLR074C 501 nt9.3□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 YMR103CYMR103C 363 nt9.3□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 KRE1YNL322C 942 nt9.29□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 PRM5YIL117C 957 nt9.28□□□□□ -0.92
SGO1Q08490 NIF3YGL221C 867 nt9.27□□□□□ -0.93
SGO1Q08490 CTI6YPL181W 1521 nt9.26□□□□□ -0.93
SGO1Q08490 BRR1YPR057W 1026 nt9.26□□□□□ -0.93
SGO1Q08490 YBL086CYBL086C 1401 nt9.25□□□□□ -0.93
SGO1Q08490 NUC1YJL208C 990 nt9.25□□□□□ -0.93
SGO1Q08490 LEU9YOR108W 1815 nt9.24□□□□□ -0.93
SGO1Q08490 IGD1YFR017C 588 nt9.23□□□□□ -0.93
SGO1Q08490 PHO23YNL097C 993 nt9.23□□□□□ -0.93
SGO1Q08490 DBP1YPL119C 1854 nt9.23□□□□□ -0.93
SGO1Q08490 BNI5YNL166C 1347 nt9.22□□□□□ -0.93
SGO1Q08490 YMR209CYMR209C 1374 nt9.21□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 DAK2YFL053W 1776 nt9.2□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 TOA2YKL058W 369 nt9.2□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 SWM1YDR260C 513 nt9.19□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 IML3YBR107C 738 nt9.19□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 HMG2YLR450W 3138 nt9.19□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 TPO4YOR273C 1980 nt9.18□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 TPS1YBR126C 1488 nt9.18□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 MSC1YML128C 1542 nt9.17□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 HXT1YHR094C 1713 nt9.17□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 YCR025CYCR025C 411 nt9.16□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 ZRT3YKL175W 1512 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 YNL024CYNL024C 741 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 IPL1YPL209C 1104 nt9.15□□□□□ -0.94
SGO1Q08490 GND2YGR256W 1479 nt9.15□□□□□ -0.95
SGO1Q08490 CDD1YLR245C 429 nt9.14□□□□□ -0.95
SGO1Q08490 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.13□□□□□ -0.95
SGO1Q08490 OYE2YHR179W 1203 nt9.12□□□□□ -0.95
SGO1Q08490 YJL067WYJL067W 351 nt9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9 ms