Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX9Q08211 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX9Q08211 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX9Q08211 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DHX9Q08211 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX9Q08211 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX9Q08211 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX9Q08211 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX9Q08211 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX9Q08211 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX9Q08211 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX9Q08211 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX9Q08211 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DHX9Q08211 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms