Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ACTN3Q08043 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN3Q08043 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTN3Q08043 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTN3Q08043 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN3Q08043 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN3Q08043 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN3Q08043 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN3Q08043 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN3Q08043 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN3Q08043 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN3Q08043 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTN3Q08043 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN3Q08043 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN3Q08043 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACTN3Q08043 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN3Q08043 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms