Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD51Q06609 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD51Q06609 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD51Q06609 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD51Q06609 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD51Q06609 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD51Q06609 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAD51Q06609 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD51Q06609 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD51Q06609 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms