Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABPB1Q06547 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABPB1Q06547 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPB1Q06547 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABPB1Q06547 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABPB1Q06547 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABPB1Q06547 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GABPB1Q06547 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABPB1Q06547 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABPB1Q06547 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABPB1Q06547 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABPB1Q06547 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GABPB1Q06547 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABPB1Q06547 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABPB1Q06547 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GABPB1Q06547 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GABPB1Q06547 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GABPB1Q06547 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GABPB1Q06547 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GABPB1Q06547 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GABPB1Q06547 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABPB1Q06547 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABPB1Q06547 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GABPB1Q06547 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABPB1Q06547 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GABPB1Q06547 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GABPB1Q06547 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABPB1Q06547 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GABPB1Q06547 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABPB1Q06547 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GABPB1Q06547 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABPB1Q06547 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABPB1Q06547 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms