Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPN12Q05209 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPN12Q05209 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPN12Q05209 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPN12Q05209 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPN12Q05209 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPN12Q05209 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPN12Q05209 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPN12Q05209 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPN12Q05209 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPN12Q05209 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPN12Q05209 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPN12Q05209 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPN12Q05209 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PTPN12Q05209 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPN12Q05209 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPN12Q05209 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPN12Q05209 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPN12Q05209 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms