Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
TOP2BQ02880 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
TOP2BQ02880 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
TOP2BQ02880 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
TOP2BQ02880 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
TOP2BQ02880 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
TOP2BQ02880 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
TOP2BQ02880 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
TOP2BQ02880 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
TOP2BQ02880 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
TOP2BQ02880 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.65■■■■■ 4.9
TOP2BQ02880 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
TOP2BQ02880 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
TOP2BQ02880 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
TOP2BQ02880 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
TOP2BQ02880 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
TOP2BQ02880 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
TOP2BQ02880 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
TOP2BQ02880 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.59■■■■■ 4.89
TOP2BQ02880 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
TOP2BQ02880 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC45.58■■■■■ 4.89
TOP2BQ02880 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
TOP2BQ02880 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
TOP2BQ02880 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
TOP2BQ02880 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
TOP2BQ02880 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
TOP2BQ02880 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
TOP2BQ02880 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.87
TOP2BQ02880 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.44■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.44■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.44■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.43■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
TOP2BQ02880 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC45.32■■■■■ 4.85
TOP2BQ02880 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
TOP2BQ02880 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
TOP2BQ02880 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
TOP2BQ02880 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
TOP2BQ02880 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.29■■■■■ 4.84
TOP2BQ02880 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
TOP2BQ02880 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
TOP2BQ02880 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
TOP2BQ02880 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.27■■■■■ 4.84
TOP2BQ02880 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
TOP2BQ02880 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
TOP2BQ02880 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
TOP2BQ02880 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
TOP2BQ02880 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
TOP2BQ02880 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
TOP2BQ02880 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
TOP2BQ02880 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.83
TOP2BQ02880 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.83
TOP2BQ02880 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC45.17■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
TOP2BQ02880 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
TOP2BQ02880 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
TOP2BQ02880 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
TOP2BQ02880 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
TOP2BQ02880 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
TOP2BQ02880 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
TOP2BQ02880 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
TOP2BQ02880 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
TOP2BQ02880 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.08■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms