Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ID3Q02535 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ID3Q02535 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ID3Q02535 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ID3Q02535 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ID3Q02535 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ID3Q02535 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ID3Q02535 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ID3Q02535 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ID3Q02535 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ID3Q02535 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ID3Q02535 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ID3Q02535 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ID3Q02535 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ID3Q02535 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ID3Q02535 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ID3Q02535 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ID3Q02535 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ID3Q02535 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ID3Q02535 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ID3Q02535 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ID3Q02535 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ID3Q02535 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ID3Q02535 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ID3Q02535 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ID3Q02535 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ID3Q02535 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ID3Q02535 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ID3Q02535 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ID3Q02535 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ID3Q02535 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ID3Q02535 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ID3Q02535 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ID3Q02535 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ID3Q02535 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ID3Q02535 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ID3Q02535 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ID3Q02535 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ID3Q02535 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ID3Q02535 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ID3Q02535 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ID3Q02535 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ID3Q02535 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ID3Q02535 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ID3Q02535 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ID3Q02535 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ID3Q02535 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ID3Q02535 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ID3Q02535 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ID3Q02535 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ID3Q02535 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ID3Q02535 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ID3Q02535 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ID3Q02535 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ID3Q02535 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ID3Q02535 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ID3Q02535 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ID3Q02535 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ID3Q02535 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ID3Q02535 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ID3Q02535 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ID3Q02535 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ID3Q02535 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ID3Q02535 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ID3Q02535 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ID3Q02535 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ID3Q02535 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ID3Q02535 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ID3Q02535 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ID3Q02535 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ID3Q02535 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ID3Q02535 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ID3Q02535 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ID3Q02535 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ID3Q02535 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ID3Q02535 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ID3Q02535 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ID3Q02535 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ID3Q02535 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ID3Q02535 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ID3Q02535 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ID3Q02535 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ID3Q02535 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ID3Q02535 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ID3Q02535 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ID3Q02535 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ID3Q02535 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ID3Q02535 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ID3Q02535 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ID3Q02535 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ID3Q02535 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ID3Q02535 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ID3Q02535 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ID3Q02535 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ID3Q02535 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ID3Q02535 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ID3Q02535 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ID3Q02535 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ID3Q02535 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ID3Q02535 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms