Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F1Q01094 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F1Q01094 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F1Q01094 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
E2F1Q01094 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms