Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SPTBN1Q01082 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTBN1Q01082 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBN1Q01082 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTBN1Q01082 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTBN1Q01082 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN1Q01082 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms