Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC5Q00444 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC5Q00444 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC5Q00444 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC5Q00444 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC5Q00444 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC5Q00444 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC5Q00444 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC5Q00444 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC5Q00444 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC5Q00444 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC5Q00444 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC5Q00444 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC5Q00444 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms