Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM3AP98173 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM3AP98173 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM3AP98173 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms