Protein–RNA interactions for Protein: P79483

HLA-DRB3, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB3P79483 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DRB3P79483 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DRB3P79483 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DRB3P79483 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DRB3P79483 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DRB3P79483 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DRB3P79483 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DRB3P79483 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRB3P79483 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DRB3P79483 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HLA-DRB3P79483 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-DRB3P79483 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRB3P79483 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRB3P79483 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DRB3P79483 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DRB3P79483 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DRB3P79483 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DRB3P79483 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms