Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HBG1P69891 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HBG1P69891 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HBG1P69891 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HBG1P69891 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HBG1P69891 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HBG1P69891 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HBG1P69891 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HBG1P69891 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HBG1P69891 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HBG1P69891 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HBG1P69891 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HBG1P69891 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HBG1P69891 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HBG1P69891 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBG1P69891 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBG1P69891 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBG1P69891 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBG1P69891 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBG1P69891 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBG1P69891 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBG1P69891 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBG1P69891 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBG1P69891 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBG1P69891 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBG1P69891 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBG1P69891 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBG1P69891 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBG1P69891 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBG1P69891 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBG1P69891 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBG1P69891 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBG1P69891 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBG1P69891 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBG1P69891 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HBG1P69891 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HBG1P69891 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HBG1P69891 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HBG1P69891 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HBG1P69891 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HBG1P69891 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HBG1P69891 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBG1P69891 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBG1P69891 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HBG1P69891 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBG1P69891 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HBG1P69891 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HBG1P69891 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HBG1P69891 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HBG1P69891 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HBG1P69891 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HBG1P69891 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HBG1P69891 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HBG1P69891 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HBG1P69891 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
HBG1P69891 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HBG1P69891 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HBG1P69891 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HBG1P69891 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HBG1P69891 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HBG1P69891 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HBG1P69891 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HBG1P69891 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HBG1P69891 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HBG1P69891 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HBG1P69891 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HBG1P69891 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HBG1P69891 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HBG1P69891 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HBG1P69891 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HBG1P69891 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HBG1P69891 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HBG1P69891 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HBG1P69891 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HBG1P69891 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HBG1P69891 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HBG1P69891 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HBG1P69891 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HBG1P69891 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HBG1P69891 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBG1P69891 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBG1P69891 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBG1P69891 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HBG1P69891 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HBG1P69891 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HBG1P69891 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HBG1P69891 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HBG1P69891 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HBG1P69891 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HBG1P69891 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HBG1P69891 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HBG1P69891 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HBG1P69891 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HBG1P69891 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HBG1P69891 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HBG1P69891 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HBG1P69891 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HBG1P69891 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HBG1P69891 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HBG1P69891 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms