Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS16P62249 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS16P62249 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS16P62249 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS16P62249 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS16P62249 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS16P62249 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS16P62249 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS16P62249 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS16P62249 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS16P62249 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS16P62249 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS16P62249 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPS16P62249 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPS16P62249 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS16P62249 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS16P62249 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS16P62249 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS16P62249 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS16P62249 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS16P62249 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS16P62249 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS16P62249 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS16P62249 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS16P62249 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS16P62249 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS16P62249 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS16P62249 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS16P62249 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS16P62249 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS16P62249 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS16P62249 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS16P62249 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS16P62249 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS16P62249 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS16P62249 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS16P62249 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS16P62249 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS16P62249 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS16P62249 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS16P62249 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS16P62249 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS16P62249 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS16P62249 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS16P62249 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS16P62249 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS16P62249 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS16P62249 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS16P62249 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS16P62249 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS16P62249 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS16P62249 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS16P62249 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS16P62249 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS16P62249 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS16P62249 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS16P62249 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS16P62249 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS16P62249 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS16P62249 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS16P62249 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS16P62249 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS16P62249 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS16P62249 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS16P62249 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS16P62249 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS16P62249 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS16P62249 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS16P62249 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS16P62249 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS16P62249 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS16P62249 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS16P62249 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS16P62249 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS16P62249 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS16P62249 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS16P62249 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS16P62249 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS16P62249 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS16P62249 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS16P62249 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS16P62249 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS16P62249 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS16P62249 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS16P62249 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS16P62249 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS16P62249 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS16P62249 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS16P62249 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS16P62249 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS16P62249 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS16P62249 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS16P62249 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS16P62249 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS16P62249 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS16P62249 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS16P62249 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS16P62249 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS16P62249 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS16P62249 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms