Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP46P62068 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP46P62068 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP46P62068 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP46P62068 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP46P62068 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP46P62068 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP46P62068 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP46P62068 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP46P62068 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP46P62068 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP46P62068 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP46P62068 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP46P62068 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP46P62068 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP46P62068 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP46P62068 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP46P62068 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP46P62068 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP46P62068 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP46P62068 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP46P62068 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP46P62068 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP46P62068 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP46P62068 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP46P62068 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP46P62068 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP46P62068 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP46P62068 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP46P62068 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP46P62068 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP46P62068 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP46P62068 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP46P62068 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP46P62068 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP46P62068 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP46P62068 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP46P62068 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP46P62068 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP46P62068 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP46P62068 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP46P62068 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP46P62068 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP46P62068 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP46P62068 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP46P62068 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP46P62068 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP46P62068 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP46P62068 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP46P62068 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP46P62068 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP46P62068 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP46P62068 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP46P62068 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP46P62068 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP46P62068 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP46P62068 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP46P62068 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP46P62068 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP46P62068 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP46P62068 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP46P62068 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP46P62068 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP46P62068 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP46P62068 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP46P62068 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP46P62068 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP46P62068 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP46P62068 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP46P62068 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP46P62068 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP46P62068 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP46P62068 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP46P62068 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP46P62068 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP46P62068 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP46P62068 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP46P62068 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP46P62068 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP46P62068 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP46P62068 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP46P62068 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP46P62068 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP46P62068 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP46P62068 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP46P62068 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP46P62068 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP46P62068 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP46P62068 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP46P62068 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP46P62068 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP46P62068 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP46P62068 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP46P62068 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP46P62068 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP46P62068 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP46P62068 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP46P62068 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP46P62068 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP46P62068 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms