Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP6V0D1P61421 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP6V0D1P61421 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP6V0D1P61421 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6V0D1P61421 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP6V0D1P61421 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP6V0D1P61421 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms