Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL27P61353 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL27P61353 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL27P61353 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL27P61353 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL27P61353 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL27P61353 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL27P61353 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL27P61353 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL27P61353 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL27P61353 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL27P61353 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL27P61353 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL27P61353 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL27P61353 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL27P61353 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL27P61353 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL27P61353 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL27P61353 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL27P61353 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL27P61353 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL27P61353 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL27P61353 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL27P61353 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL27P61353 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL27P61353 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL27P61353 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL27P61353 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL27P61353 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL27P61353 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL27P61353 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL27P61353 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL27P61353 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL27P61353 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL27P61353 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL27P61353 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL27P61353 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL27P61353 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL27P61353 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL27P61353 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL27P61353 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPL27P61353 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL27P61353 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL27P61353 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL27P61353 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL27P61353 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL27P61353 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL27P61353 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL27P61353 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL27P61353 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL27P61353 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL27P61353 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL27P61353 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL27P61353 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL27P61353 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL27P61353 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL27P61353 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL27P61353 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL27P61353 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL27P61353 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL27P61353 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL27P61353 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL27P61353 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL27P61353 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL27P61353 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL27P61353 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL27P61353 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL27P61353 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL27P61353 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL27P61353 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL27P61353 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL27P61353 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL27P61353 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL27P61353 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL27P61353 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL27P61353 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL27P61353 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL27P61353 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL27P61353 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL27P61353 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL27P61353 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL27P61353 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL27P61353 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL27P61353 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL27P61353 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL27P61353 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL27P61353 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL27P61353 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL27P61353 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL27P61353 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL27P61353 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL27P61353 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL27P61353 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL27P61353 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL27P61353 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL27P61353 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL27P61353 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL27P61353 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL27P61353 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL27P61353 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms