Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB8AP61006 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB8AP61006 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB8AP61006 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB8AP61006 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms