Protein–RNA interactions for Protein: P60153

RNASE9, Inactive ribonuclease-like protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE9P60153 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RNASE9P60153 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNASE9P60153 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNASE9P60153 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNASE9P60153 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNASE9P60153 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNASE9P60153 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNASE9P60153 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNASE9P60153 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNASE9P60153 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNASE9P60153 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNASE9P60153 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNASE9P60153 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RNASE9P60153 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNASE9P60153 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNASE9P60153 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms