Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3S2P59780 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3S2P59780 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3S2P59780 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3S2P59780 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3S2P59780 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms