Protein–RNA interactions for Protein: P58418

CLRN1, Clarin-1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1P58418 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLRN1P58418 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLRN1P58418 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLRN1P58418 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLRN1P58418 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLRN1P58418 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLRN1P58418 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLRN1P58418 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLRN1P58418 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms