Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN20P56880 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN20P56880 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN20P56880 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN20P56880 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN20P56880 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN20P56880 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN20P56880 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN20P56880 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms