Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH12P55289 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH12P55289 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH12P55289 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH12P55289 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH12P55289 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH12P55289 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH12P55289 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH12P55289 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH12P55289 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH12P55289 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH12P55289 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH12P55289 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH12P55289 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH12P55289 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH12P55289 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH12P55289 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH12P55289 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH12P55289 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH12P55289 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH12P55289 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH12P55289 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH12P55289 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH12P55289 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH12P55289 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH12P55289 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH12P55289 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH12P55289 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH12P55289 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH12P55289 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH12P55289 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH12P55289 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH12P55289 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH12P55289 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH12P55289 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH12P55289 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH12P55289 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH12P55289 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH12P55289 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH12P55289 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH12P55289 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH12P55289 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH12P55289 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH12P55289 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH12P55289 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH12P55289 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH12P55289 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH12P55289 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH12P55289 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH12P55289 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH12P55289 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH12P55289 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH12P55289 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH12P55289 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH12P55289 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH12P55289 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH12P55289 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH12P55289 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH12P55289 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH12P55289 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH12P55289 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH12P55289 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH12P55289 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH12P55289 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH12P55289 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH12P55289 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH12P55289 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH12P55289 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH12P55289 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH12P55289 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH12P55289 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH12P55289 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH12P55289 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH12P55289 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH12P55289 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH12P55289 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH12P55289 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH12P55289 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH12P55289 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH12P55289 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH12P55289 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH12P55289 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH12P55289 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH12P55289 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH12P55289 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH12P55289 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH12P55289 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH12P55289 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH12P55289 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH12P55289 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH12P55289 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH12P55289 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH12P55289 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH12P55289 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH12P55289 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH12P55289 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH12P55289 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH12P55289 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH12P55289 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH12P55289 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms