Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP6P55212 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP6P55212 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP6P55212 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP6P55212 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP6P55212 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP6P55212 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP6P55212 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP6P55212 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP6P55212 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP6P55212 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP6P55212 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP6P55212 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP6P55212 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP6P55212 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP6P55212 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP6P55212 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP6P55212 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP6P55212 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP6P55212 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP6P55212 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP6P55212 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP6P55212 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP6P55212 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP6P55212 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP6P55212 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP6P55212 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP6P55212 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP6P55212 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP6P55212 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP6P55212 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP6P55212 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP6P55212 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP6P55212 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP6P55212 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP6P55212 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP6P55212 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP6P55212 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP6P55212 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP6P55212 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP6P55212 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP6P55212 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP6P55212 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP6P55212 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP6P55212 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP6P55212 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP6P55212 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP6P55212 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP6P55212 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP6P55212 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP6P55212 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP6P55212 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP6P55212 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP6P55212 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP6P55212 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP6P55212 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP6P55212 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP6P55212 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP6P55212 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP6P55212 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP6P55212 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP6P55212 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP6P55212 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP6P55212 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP6P55212 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP6P55212 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP6P55212 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP6P55212 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP6P55212 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP6P55212 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP6P55212 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP6P55212 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP6P55212 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP6P55212 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP6P55212 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP6P55212 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP6P55212 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP6P55212 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP6P55212 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP6P55212 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP6P55212 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP6P55212 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP6P55212 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP6P55212 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP6P55212 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP6P55212 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP6P55212 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP6P55212 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP6P55212 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP6P55212 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP6P55212 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP6P55212 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP6P55212 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP6P55212 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP6P55212 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP6P55212 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP6P55212 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP6P55212 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP6P55212 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP6P55212 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms