Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN5P54829 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN5P54829 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN5P54829 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN5P54829 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPN5P54829 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN5P54829 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN5P54829 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN5P54829 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN5P54829 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN5P54829 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN5P54829 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN5P54829 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN5P54829 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN5P54829 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN5P54829 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN5P54829 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN5P54829 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN5P54829 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN5P54829 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN5P54829 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN5P54829 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN5P54829 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN5P54829 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms