Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IST1P53990 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IST1P53990 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IST1P53990 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IST1P53990 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IST1P53990 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IST1P53990 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IST1P53990 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IST1P53990 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IST1P53990 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IST1P53990 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IST1P53990 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IST1P53990 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IST1P53990 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IST1P53990 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IST1P53990 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IST1P53990 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IST1P53990 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IST1P53990 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IST1P53990 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IST1P53990 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IST1P53990 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IST1P53990 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IST1P53990 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IST1P53990 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IST1P53990 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IST1P53990 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IST1P53990 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IST1P53990 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IST1P53990 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IST1P53990 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IST1P53990 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IST1P53990 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IST1P53990 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IST1P53990 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IST1P53990 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IST1P53990 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IST1P53990 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IST1P53990 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IST1P53990 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IST1P53990 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IST1P53990 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IST1P53990 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IST1P53990 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IST1P53990 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IST1P53990 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IST1P53990 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IST1P53990 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IST1P53990 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IST1P53990 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IST1P53990 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IST1P53990 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IST1P53990 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IST1P53990 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IST1P53990 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IST1P53990 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IST1P53990 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IST1P53990 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IST1P53990 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IST1P53990 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IST1P53990 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IST1P53990 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IST1P53990 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IST1P53990 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IST1P53990 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IST1P53990 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IST1P53990 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IST1P53990 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IST1P53990 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IST1P53990 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IST1P53990 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IST1P53990 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IST1P53990 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IST1P53990 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IST1P53990 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IST1P53990 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IST1P53990 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IST1P53990 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IST1P53990 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IST1P53990 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IST1P53990 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IST1P53990 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IST1P53990 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IST1P53990 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IST1P53990 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IST1P53990 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IST1P53990 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IST1P53990 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IST1P53990 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IST1P53990 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IST1P53990 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IST1P53990 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IST1P53990 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IST1P53990 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IST1P53990 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IST1P53990 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IST1P53990 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IST1P53990 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IST1P53990 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IST1P53990 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms