Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARFIP2P53365 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFIP2P53365 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFIP2P53365 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFIP2P53365 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFIP2P53365 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFIP2P53365 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFIP2P53365 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFIP2P53365 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFIP2P53365 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFIP2P53365 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFIP2P53365 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFIP2P53365 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFIP2P53365 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ARFIP2P53365 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARFIP2P53365 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFIP2P53365 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARFIP2P53365 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARFIP2P53365 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFIP2P53365 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFIP2P53365 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFIP2P53365 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFIP2P53365 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms