Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A1P53007 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A1P53007 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A1P53007 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A1P53007 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A1P53007 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A1P53007 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC25A1P53007 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC25A1P53007 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A1P53007 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A1P53007 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A1P53007 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A1P53007 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A1P53007 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A1P53007 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A1P53007 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A1P53007 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A1P53007 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC25A1P53007 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A1P53007 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A1P53007 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms