Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFNA3P52797 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFNA3P52797 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFNA3P52797 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFNA3P52797 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNA3P52797 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA3P52797 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFNA3P52797 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA3P52797 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNA3P52797 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms