Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAP1GDS1P52306 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAP1GDS1P52306 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAP1GDS1P52306 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAP1GDS1P52306 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAP1GDS1P52306 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAP1GDS1P52306 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAP1GDS1P52306 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAP1GDS1P52306 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAP1GDS1P52306 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAP1GDS1P52306 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAP1GDS1P52306 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RAP1GDS1P52306 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAP1GDS1P52306 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAP1GDS1P52306 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAP1GDS1P52306 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAP1GDS1P52306 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms