Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGDP52209 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGDP52209 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGDP52209 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGDP52209 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGDP52209 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGDP52209 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGDP52209 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGDP52209 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGDP52209 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGDP52209 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGDP52209 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGDP52209 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGDP52209 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGDP52209 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGDP52209 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGDP52209 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGDP52209 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGDP52209 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PGDP52209 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGDP52209 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGDP52209 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGDP52209 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGDP52209 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGDP52209 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGDP52209 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGDP52209 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGDP52209 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGDP52209 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGDP52209 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGDP52209 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGDP52209 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGDP52209 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGDP52209 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGDP52209 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGDP52209 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PGDP52209 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGDP52209 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGDP52209 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGDP52209 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGDP52209 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGDP52209 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGDP52209 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGDP52209 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGDP52209 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGDP52209 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGDP52209 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGDP52209 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGDP52209 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGDP52209 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGDP52209 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGDP52209 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGDP52209 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGDP52209 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGDP52209 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGDP52209 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PGDP52209 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGDP52209 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGDP52209 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGDP52209 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGDP52209 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGDP52209 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGDP52209 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGDP52209 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGDP52209 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGDP52209 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGDP52209 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGDP52209 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGDP52209 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGDP52209 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGDP52209 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGDP52209 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGDP52209 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGDP52209 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGDP52209 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGDP52209 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGDP52209 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGDP52209 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGDP52209 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PGDP52209 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGDP52209 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGDP52209 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGDP52209 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGDP52209 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGDP52209 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGDP52209 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGDP52209 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGDP52209 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGDP52209 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGDP52209 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGDP52209 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PGDP52209 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGDP52209 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGDP52209 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGDP52209 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGDP52209 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGDP52209 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGDP52209 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGDP52209 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGDP52209 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms