Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCR3P51677 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCR3P51677 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCR3P51677 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR3P51677 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR3P51677 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR3P51677 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR3P51677 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR3P51677 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCR3P51677 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCR3P51677 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCR3P51677 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCR3P51677 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCR3P51677 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCR3P51677 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCR3P51677 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCR3P51677 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCR3P51677 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCR3P51677 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCR3P51677 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCR3P51677 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCR3P51677 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCR3P51677 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCR3P51677 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCR3P51677 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCR3P51677 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCR3P51677 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCR3P51677 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCR3P51677 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCR3P51677 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCR3P51677 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCR3P51677 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCR3P51677 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCR3P51677 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCR3P51677 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCR3P51677 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCR3P51677 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCR3P51677 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCR3P51677 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCR3P51677 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCR3P51677 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCR3P51677 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCR3P51677 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCR3P51677 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCR3P51677 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCR3P51677 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCR3P51677 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCR3P51677 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCR3P51677 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCR3P51677 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCR3P51677 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCR3P51677 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCR3P51677 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCR3P51677 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCR3P51677 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCR3P51677 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCR3P51677 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCR3P51677 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCR3P51677 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCR3P51677 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCR3P51677 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCR3P51677 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCR3P51677 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCR3P51677 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCR3P51677 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCR3P51677 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCR3P51677 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCR3P51677 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCR3P51677 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCR3P51677 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCR3P51677 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCR3P51677 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCR3P51677 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCR3P51677 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCR3P51677 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCR3P51677 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCR3P51677 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCR3P51677 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCR3P51677 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCR3P51677 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCR3P51677 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCR3P51677 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCR3P51677 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCR3P51677 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCR3P51677 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCR3P51677 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCR3P51677 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCR3P51677 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCR3P51677 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCR3P51677 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCR3P51677 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCR3P51677 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCR3P51677 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCR3P51677 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCR3P51677 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCR3P51677 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCR3P51677 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCR3P51677 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCR3P51677 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCR3P51677 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms