Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.34■■■■■ 5.49
SMARCA4P51532 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC49.33■■■■■ 5.49
SMARCA4P51532 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC49.28■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC49.28■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC49.27■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.27■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC49.27■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
SMARCA4P51532 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC49.25■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC49.24■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC49.23■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.22■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC49.2■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.19■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
SMARCA4P51532 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
SMARCA4P51532 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
SMARCA4P51532 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC49.16■■■■■ 5.46
SMARCA4P51532 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
SMARCA4P51532 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
SMARCA4P51532 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
SMARCA4P51532 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
SMARCA4P51532 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
SMARCA4P51532 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
SMARCA4P51532 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
SMARCA4P51532 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
SMARCA4P51532 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
SMARCA4P51532 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC49.11■■■■■ 5.45
SMARCA4P51532 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
SMARCA4P51532 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
SMARCA4P51532 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
SMARCA4P51532 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.09■■■■■ 5.45
SMARCA4P51532 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
SMARCA4P51532 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
SMARCA4P51532 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC49.06■■■■■ 5.44
SMARCA4P51532 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC49.05■■■■■ 5.44
SMARCA4P51532 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
SMARCA4P51532 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC49.03■■■■■ 5.44
SMARCA4P51532 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
SMARCA4P51532 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
SMARCA4P51532 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
SMARCA4P51532 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
SMARCA4P51532 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
SMARCA4P51532 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
SMARCA4P51532 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
SMARCA4P51532 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.97■■■■■ 5.43
SMARCA4P51532 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC48.96■■■■■ 5.43
SMARCA4P51532 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
SMARCA4P51532 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC48.94■■■■■ 5.42
SMARCA4P51532 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
SMARCA4P51532 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
SMARCA4P51532 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
SMARCA4P51532 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
SMARCA4P51532 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
SMARCA4P51532 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
SMARCA4P51532 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC48.87■■■■■ 5.41
SMARCA4P51532 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
SMARCA4P51532 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
SMARCA4P51532 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC48.84■■■■■ 5.41
SMARCA4P51532 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
SMARCA4P51532 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
SMARCA4P51532 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
SMARCA4P51532 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC48.81■■■■■ 5.4
SMARCA4P51532 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC48.8■■■■■ 5.4
SMARCA4P51532 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
SMARCA4P51532 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC48.79■■■■■ 5.4
SMARCA4P51532 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC48.78■■■■■ 5.4
SMARCA4P51532 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
SMARCA4P51532 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC48.74■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC48.74■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.73■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.73■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.73■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC48.72■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.72■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms