Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPT1P50897 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPT1P50897 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPT1P50897 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPT1P50897 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPT1P50897 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPT1P50897 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPT1P50897 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPT1P50897 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPT1P50897 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPT1P50897 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPT1P50897 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPT1P50897 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPT1P50897 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPT1P50897 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPT1P50897 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPT1P50897 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPT1P50897 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPT1P50897 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPT1P50897 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPT1P50897 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPT1P50897 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPT1P50897 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPT1P50897 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPT1P50897 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPT1P50897 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPT1P50897 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPT1P50897 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPT1P50897 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPT1P50897 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPT1P50897 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPT1P50897 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPT1P50897 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPT1P50897 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPT1P50897 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPT1P50897 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPT1P50897 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPT1P50897 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPT1P50897 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPT1P50897 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPT1P50897 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPT1P50897 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPT1P50897 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPT1P50897 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPT1P50897 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPT1P50897 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPT1P50897 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPT1P50897 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPT1P50897 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPT1P50897 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPT1P50897 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPT1P50897 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPT1P50897 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPT1P50897 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPT1P50897 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPT1P50897 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPT1P50897 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPT1P50897 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPT1P50897 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPT1P50897 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPT1P50897 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPT1P50897 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPT1P50897 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPT1P50897 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPT1P50897 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPT1P50897 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPT1P50897 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPT1P50897 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PPT1P50897 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPT1P50897 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPT1P50897 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPT1P50897 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPT1P50897 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPT1P50897 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPT1P50897 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPT1P50897 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPT1P50897 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPT1P50897 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPT1P50897 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPT1P50897 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPT1P50897 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPT1P50897 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPT1P50897 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPT1P50897 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPT1P50897 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPT1P50897 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPT1P50897 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPT1P50897 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPT1P50897 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPT1P50897 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPT1P50897 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPT1P50897 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPT1P50897 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPT1P50897 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPT1P50897 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPT1P50897 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPT1P50897 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPT1P50897 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPT1P50897 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPT1P50897 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms