Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASCL1P50553 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASCL1P50553 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASCL1P50553 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL1P50553 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms