Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK3P49761 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK3P49761 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK3P49761 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK3P49761 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK3P49761 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK3P49761 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK3P49761 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK3P49761 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK3P49761 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK3P49761 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK3P49761 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK3P49761 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK3P49761 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK3P49761 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK3P49761 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK3P49761 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK3P49761 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK3P49761 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK3P49761 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK3P49761 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK3P49761 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK3P49761 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK3P49761 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK3P49761 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK3P49761 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK3P49761 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK3P49761 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK3P49761 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLK3P49761 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK3P49761 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK3P49761 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK3P49761 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK3P49761 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLK3P49761 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK3P49761 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK3P49761 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK3P49761 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK3P49761 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK3P49761 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK3P49761 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK3P49761 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK3P49761 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK3P49761 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK3P49761 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK3P49761 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK3P49761 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK3P49761 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLK3P49761 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLK3P49761 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLK3P49761 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK3P49761 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK3P49761 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK3P49761 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK3P49761 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK3P49761 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK3P49761 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK3P49761 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK3P49761 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK3P49761 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK3P49761 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK3P49761 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK3P49761 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK3P49761 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK3P49761 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK3P49761 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK3P49761 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK3P49761 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK3P49761 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK3P49761 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK3P49761 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK3P49761 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK3P49761 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK3P49761 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK3P49761 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK3P49761 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLK3P49761 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK3P49761 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK3P49761 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK3P49761 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK3P49761 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK3P49761 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK3P49761 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK3P49761 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLK3P49761 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK3P49761 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK3P49761 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK3P49761 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK3P49761 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK3P49761 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK3P49761 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK3P49761 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK3P49761 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK3P49761 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK3P49761 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK3P49761 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK3P49761 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK3P49761 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK3P49761 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK3P49761 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms