Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CX3CR1P49238 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CX3CR1P49238 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CX3CR1P49238 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CX3CR1P49238 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms