Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCT5P48643 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCT5P48643 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCT5P48643 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCT5P48643 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCT5P48643 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCT5P48643 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCT5P48643 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCT5P48643 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCT5P48643 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCT5P48643 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCT5P48643 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCT5P48643 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCT5P48643 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCT5P48643 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCT5P48643 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCT5P48643 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCT5P48643 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCT5P48643 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCT5P48643 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCT5P48643 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCT5P48643 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCT5P48643 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCT5P48643 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT5P48643 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT5P48643 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT5P48643 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT5P48643 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT5P48643 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT5P48643 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT5P48643 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT5P48643 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT5P48643 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT5P48643 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT5P48643 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT5P48643 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT5P48643 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT5P48643 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT5P48643 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT5P48643 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT5P48643 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT5P48643 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCT5P48643 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT5P48643 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT5P48643 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT5P48643 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT5P48643 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT5P48643 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT5P48643 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCT5P48643 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT5P48643 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT5P48643 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT5P48643 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT5P48643 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT5P48643 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT5P48643 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT5P48643 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT5P48643 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT5P48643 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT5P48643 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT5P48643 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT5P48643 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT5P48643 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT5P48643 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT5P48643 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT5P48643 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT5P48643 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCT5P48643 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCT5P48643 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCT5P48643 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCT5P48643 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCT5P48643 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCT5P48643 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCT5P48643 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCT5P48643 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCT5P48643 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCT5P48643 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCT5P48643 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCT5P48643 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCT5P48643 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCT5P48643 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCT5P48643 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCT5P48643 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCT5P48643 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCT5P48643 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCT5P48643 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCT5P48643 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCT5P48643 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCT5P48643 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCT5P48643 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT5P48643 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT5P48643 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT5P48643 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT5P48643 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCT5P48643 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCT5P48643 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCT5P48643 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCT5P48643 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCT5P48643 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCT5P48643 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms