Protein–RNA interactions for Protein: P48549

KCNJ3, G protein-activated inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ3P48549 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNJ3P48549 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNJ3P48549 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ3P48549 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNJ3P48549 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms