Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
IQGAP1P46940 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
IQGAP1P46940 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
IQGAP1P46940 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
IQGAP1P46940 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
IQGAP1P46940 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IQGAP1P46940 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IQGAP1P46940 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
IQGAP1P46940 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
IQGAP1P46940 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
IQGAP1P46940 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.71■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms